根据支队工作性质，全支队共设四个科室，一个举报投诉中心，一个机动大队。
党政办公室工作职责
一、 加强内部管理，组织人员开展学习，落实劳动纪律制度；
二、 负责办文、办会、办事和日常事务性工作；
三、 做好党务工作。加强党组织建设，建立健全各级党组织，加强党员的教育和培养，做好新党员发展工作。
四、 搞好劳动、组织、人事、工资、医保、社保、档案、公积金和财务工作，做好干部职工的年度考核；
五、 加大政务工作的督查督办力度，确保各项工作落实；
六、 做好来信来访的接待、登记、处理、来访工作；
七、 负责工会、共青团、妇联等群团工作；
八、 做好对外联络和各科室协调工作
九、 做好后勤保障、公务接待、车辆及公物管理、安全生产和社会综合治理等工作；
十、 积极做好老干部工作；
十一、做好国有资产的管理工作；
十二、完成支队领导和上级部门交办的各项工作.
酒类管理执法科职责
1、贯彻落实国家、省有关酒类流通管理方面的法律、法规、政策，负责市城区酒类流通监督管理工作。
2、负责办理酒类备案登记工作，发放、回收、管理《酒类流通随附单》及酒类购销台账。
3、负责市城区酒类违法案件的查处工作，依法打击生产、经营假冒伪劣酒类行为。
4、负责组织全市酒类执法人员和酒类经营人员的培训工作
5、负责酒类流通信息和报表的报送工作。
6、完成支队领导交办的其它工作。
屠宰管理执法科工作职责
1、贯彻执行国家、省有关屠宰管理的法律、法规、规章，并落实有关屠宰行业标准；
2、受市政府委托，执行依法设立或撤销定点屠宰企业的决定；
3、实施对全市生猪定点屠宰厂（场）的管理，对定点屠宰加工、市场供应等环节的协调，确保肉品供应不断 档、不脱销，维护好市 城区肉品市场经营秩序；
4、组织相关各职能部门依法取缔私屠宰窝点，查处私屠滥宰违法行为，处理因猪肉质量安全突发性事件；
5、负责组织各相关职能部门对城区所有农贸市场、餐饮行业、集体伙食单位、超市、肉类制品加工企业以及外来冷鲜（冻）肉品销售加工的监管检查等工作；
6、指导、监督、检查、综合和协调各县（市）屠宰管理工作
7、采取多种途径开展生猪定点屠宰法律、法规政策宣传；
8、完成领导交办的其他工作。
综合管理执法科职责
1、贯彻执行国家、省有关成品油市场、再生资源回收、美容美发、洗染、报废汽车回收、二手车流通、拍卖、典当、零售商促销行为、零售商供应公平交易、展览展销、饮食服务业等方面的法律、法规。
2、负责主要业务企业的登记及监督管理工作。
3、负责市城区业务范围内案件的查处工作，依法打击生产、经营假冒伪劣产品行为。
4、负责有关部门所需的信息和报表工作。
5、完成支队领导交办的其它工作。
12312商务举报投诉服务中心工作职责
一、依法受理、转办、督办社会公众和机关、企事业单位对生猪屠宰、酒类流通、特许经营、零售商促销、零供交易、报废汽车回收、家电下乡、技术进出口、对外劳务合作、对外承包工程等内外贸、外经领域和反倾销、反补贴、反垄断等违反商务领域法律法规行为的举报投诉。
二、依法对受理的举报投诉案件进行梳理分类，根据举报投诉内容分送、移交至有关县（市）商务部门或市商务局机关相关科室调查处理，并做好跟踪督办工作.
三、按规定时间向有关部门了解案件办理进度，及时向举报投诉人反馈案件的查处办理情况。
四、为社会公众和企业提供商务领域有关法律、法规、规章、规范性文件，以及行政审批和办事程序等方面的咨询、指导服务、
五、负责采集、上报商务领域管理秩序中的突发事件、国内外贸易中的异常情况以及市场经济秩序方面的重要信息。
六、收集、统计、上报全省商务领域的举报投诉信息和商务执法数据，为行政执法部门提供市场监管决策依据。
七、接受社会各界对商务领域行政执法工作的意见和建议。
机动大队工作职责
为了全面推进商务综合执法法制化建设，积极营造健康、和谐、稳定的经济环境，大力提升商务执法水平，树立公正、文明、廉洁的执法形象，为我市经济建设服务，特制定本职责。
一、全体机动大队执法队员要端正思想，以积极健康的热情投身到商务执法工作中去。
二、认真学习商务执法相关的法律、法规、规章和政策，熟悉并掌握相关执法依据，严格依照执法程序，先亮证再执法，严肃执法纪律，规范执法行为，积极提高自身执法水平和依法行政的能力。
三、调查研究，掌握情况，现场取证，实事求是，公正文明执法，接受社会监督。
四、依法行使行政执法权，严格按照法律法规规定及规章制度办事，廉洁奉公。
五、严肃工作纪律，落实工作职责，严禁“吃、拿、卡、要”接受行政执法相对人宴请、钱物；严禁泄露行动秘密，为涉嫌个体经营户通风报信；严禁单独一人执法和无票据收费罚没；严禁擅自处理没收物质；严禁具体执法过程中畏缩不前或临阵脱逃；严禁以罚代收、以罚代管。坚持按时上下班和请销假制度。因地因时制宜合理安排执法工作；坚持每天无规律检查和重点区域重点突查相结合，实现全面管理；坚持秉公执法，文明执法，杜绝粗暴鲁莽执法行为，做到公开、公平、公正，树立良好执法形象；坚持举报查证落实制度，并及时回复做好查证记录备案。
六、积极完成上级交办的工作。